tbl2asn Gerar link Facebook X Pinterest E-mail Outros aplicativos setembro 17, 2021 tbl2asn -t ../template_CPs.sbt -i Uf_v2.fasta -j "[organism=Utricularia ] [voucher=xxxx]" -f U_nw. tbl -V vb Leia mais
separando genoma em arquivos menores (5000 sequências em cada arquivo), no exemplo. Gerar link Facebook X Pinterest E-mail Outros aplicativos junho 30, 2021 awk 'BEGIN {n_seq=0;} /^>/ {if(n_seq%5000==0){file=sprintf("myseq%d.fa",n_seq);} print >> file; n_seq++; next;} { print >> file; }' < Athaliana_447_Araport11.protein_primaryTranscriptOnly_renamed.fa Leia mais
Média da primeira coluna usando awk Gerar link Facebook X Pinterest E-mail Outros aplicativos junho 24, 2021 awk '{ total += $1 } END { print total/NR }' Leia mais